Warning: Undefined array key "path" in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php on line 27

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831

Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-content/mu-plugins/vm_wp.php:27) in /data02/virt60861/domeenid/www.piimaklaster.ee/htdocs/wp-includes/rest-api/class-wp-rest-server.php on line 1831
{"id":1212,"date":"2021-09-21T14:35:50","date_gmt":"2021-09-21T14:35:50","guid":{"rendered":"https:\/\/piimaklaster.ee\/?page_id=1212"},"modified":"2021-09-21T15:38:16","modified_gmt":"2021-09-21T15:38:16","slug":"eesti-piimaveiste-populatsiooni-hindamine-genoomaretusvaartuse-alusel","status":"publish","type":"page","link":"https:\/\/piimaklaster.ee\/eesti-piimaveiste-populatsiooni-hindamine-genoomaretusvaartuse-alusel\/","title":{"rendered":"Eesti piimaveiste populatsiooni hindamine genoomaretusv\u00e4\u00e4rtuse alusel"},"content":{"rendered":"

Eesti piimaveiste populatsiooni valimi hindamine genoomaretusv\u00e4\u00e4rtuse alusel toimus vastavalt suurima holsteini populatsiooniga Saksamaa aretusv\u00e4\u00e4rtuste alusel (eesti hol\u0161teini t\u00f5ug, EHF)\u00a0 ja eesti punase t\u00f5ugu (EPK) loomad P\u00f5hjamaade aretusv\u00e4\u00e4rtuste alusel. Tegevuse eesm\u00e4rk oli anda hinnang siinse populatsiooni aretusv\u00e4\u00e4rtuste sidumise v\u00f5imalikkusest ja hindamise alustamisest EuroGenoomi kuuluva ja sellega seotud organisatsioonide abil: Saksamaa hol\u0161teini populatsioon (GGI-Spermex) eesti ho\u0161teini t\u00f5u ja P\u00f5hjamaad punase t\u00f5u kohta (VikingGenetics). Saksamaa aretusv\u00e4\u00e4rtuste hinnete alusel antakse hinnang EHF ning eesti punase t\u00f5ugu looma aretusv\u00e4\u00e4rtuste hinded v\u00e4ljastab VikingGenetics P\u00f5hjamaade skaalal.<\/p>\n

Aretusv\u00e4\u00e4rtused uuendatakse kolm korda aastas ning seotakse Eesti P\u00f5llumajandusloomade J\u00f5udluskontrolli AS (EPJ) andmebaasis looma j\u00f5udluse andmetega. Projekti tellimusel tehti t\u00e4iendused programmis Vissuke \u00fcksiklooma kaardil genot\u00fcpiseerimise andmete kuvamiseks, mida varem ei olnud. Samuti on v\u00f5imalik neid n\u00e4ha omanikul oma loomade grupi puhul.<\/p>\n

Projekti t\u00f6\u00f6d tehti Piimaklastri, Eesti T\u00f5uloomakasvatajate \u00dchistu (ETK\u00dc) ja\u00a0 Tervisetehnoloogiate Arenduskeskus AS (TTAK)\u00a0 kaheaastase \u00fchist\u00f6\u00f6na ja olid liigendatud kolme ossa:<\/p>\n

I osa Loomade nimekirja koostamine ja genot\u00fcpiseerimiseks vajalike proovide kogumine<\/strong><\/h5>\n

Koost\u00f6\u00f6s Saksamaa aretusorganisatsiooni GGI-Spermexiga saadeti ETK\u00dc poolt koostatud nimekirja alusel looma reg. nr p\u00f5hised k\u00f5rvam\u00e4rgid Eestisse ning ETK\u00dc spetsialistid kogusid vastavalt juhenditele \u00fche aastaste lehmikute proovid farmidest. VikingGeneticule anal\u00fc\u00fcsideks olid vajalikud vereproovid. Koguti\u00a0 ca 2200 looma proovid, umbes 120 eri farmist, mis on umbes 10% k\u00f5ikidest aastas s\u00fcndivatest lehmikutest.<\/p>\n

 <\/p>\n

II osa. Genot\u00fcpiseerimise l\u00e4biviimine, toorandmete ja aretusv\u00e4\u00e4rtuste Eestisse toomine<\/strong><\/h5>\n

TTAK korraldas proovide saatmise vastavalt Saksamaale ja Taani. Saksamaa Aretusorganisatsiooni labor VIT (Vereinigte Informationssysteme Tierhaltung w.V.) viis l\u00e4bi genot\u00fcpiseerimise ja v\u00e4ljastas saadud andmetele toetudes aretusv\u00e4\u00e4rtused Saksamaa skaalal. VikingGenetics korraldas sama moodi eesti punase t\u00f5ugu looma genot\u00fcpiseerimise oma laboris Taanis ja v\u00e4ljastas aretusv\u00e4\u00e4rtused P\u00f5hjamaade skaalal. Vastavalt kokkulepetele saksa ja taani osapooltega\u00a0 laeti arutusv\u00e4\u00e4rtustega seotud andmed EPJ andmebaasi.<\/p>\n

 <\/p>\n

III osa. Aretusv\u00e4\u00e4rtuste sidumine\u00a0 EPJ andmebaasiga ja eesti holsteini t\u00f5ugu piimaveiste (valimi genot\u00fc\u00fcbiandmetel p\u00f5hineva) ning eesti punast t\u00f5ugu piimaveiste (valimi genot\u00fc\u00fcbiandmetel p\u00f5hineva) aretusv\u00e4\u00e4rtuse koostamine ja katsetamine.<\/strong><\/h5>\n

TTAK teadlaste poolt tehtud anal\u00fc\u00fcs eesti piimaveiste populatsiooni hindamisest<\/a> on leitav eelpoolse lingi alt. L\u00fchikokkuv\u00f5te leitav kaks l\u00f5iku allpool.<\/p>\n

Projekti \u00fche t\u00f6\u00f6na loodi EPJ andmebaasis looma-andmete hulgas eraldi genoomaretusv\u00e4\u00e4rtuste osa ja edaspidi kuvatakse neid programmis Vissuke looma kaardil. Juba genoomhinnatud loomade andmeid v\u00e4rskendatakse kolm korda aastas. Samuti on v\u00f5imalik neid n\u00e4ha omanikul oma loomade grupi puhul. Seda v\u00f5imalust varem ei olnud. Projekti j\u00e4rel on saavad ka tulevaste genot\u00fcpiseeritavate loomade andmeid samamoodi kasutada ja n\u00e4ha. N\u00e4idised Vissukese kuvadest on leitavad \u00fclalpool viidatud anal\u00fc\u00fcsi lk 44. Samuti on soovijatel v\u00f5imalik saada personaalne konsultatsioon leppides selle kokku ETK\u00dc t\u00f5uaretusosakonna juhataja T\u00f5nu P\u00f5llu\u00e4\u00e4re v\u00f5i EPJ juhataja Kaivo Ilvese juures. Lisaks j\u00e4tkuvad praktilised koolitused ning loomapidajate n\u00f5ustamine genot\u00fcpiseerimise kasutamisest aretustegevuse t\u00f6\u00f6riistana peale projekti l\u00f5ppu.<\/p>\n

T\u00f6\u00f6de juhtpartner oli TTAK, ETK\u00dc andis soovitused andmete kuvamisest ning vastutas l\u00f5pptulemuste kontrollimise eest.<\/p>\n

 <\/p>\n

Kokkuv\u00f5te eesti hol\u0161teini t\u00f5ugu lehmikute ja pullide genoomaretusv\u00e4\u00e4rtustest<\/strong><\/h4>\n
    \n
  • Nii genoomhinnatud eesti hol\u0161teini t\u00f5ugu (EHF) lehmikute kui ka pullide hulgas eksisteerib k\u00f5igi hinnatud aretusv\u00e4\u00e4rtuste ja -indeksite osas valikute tegemiseks piisav geneetiline varieeruvus. Siiski on varieeruvus suhteliselt suurem piimaj\u00f5udlusn\u00e4itajate ja v\u00e4iksem tervisetunnuste osas. Kuna Eestis geneetilisi haigusriske (so haiguste aretusv\u00e4\u00e4rtuseid) veel ei hinnata, enamuse farmide puhul ei talletata andmebaasides ka loomade haiguste ja ravi andmeid, on loomade genoomiandmete alusel v\u00e4lismaal \u00fclimahukate andmebaaside alusel arvutatud genoomaretusv\u00e4\u00e4rtused ainsad v\u00f5imalused geneetiliste riskide populatsioonip\u00f5hise varieeruvuse ja individuaalsete geneetiliste riskide hindamiseks.<\/li>\n
  • Enamus EHF lehmikute ja pullide genoomaretusv\u00e4\u00e4rtustest on k\u00f5rgemad kui baaspopulatsioonis (va v\u00e4limikutunnuste osas, aga seal v\u00f5ivad rolli m\u00e4ngida v\u00e4limikutunnuste pisut erinevad definitsioonid ja erinevad optimaalsed v\u00e4\u00e4rtused Eestis ja Saksamaal). See t\u00e4hendab, et v\u00f5rreldes Saksamaal aastatel 2014-2016 s\u00fcndinud lehmadega on aastatel 2015-2019 s\u00fcndinud EHF pullide ja aastatel 2018-2020 s\u00fcndinud EHF lehmikute geneetiline potentsiaal k\u00f5rgem nii toodangu, karjasp\u00fcsivuse, sigivuse, poegimise kui ka tervise osas.<\/li>\n
  • EHF pullide geneetiline varieeruvus on, hoolimata nende suhteliselt v\u00e4ikesest arvust ja eelvalikust, sama suur, kui populatsioonist juhuslikult valitud sama t\u00f5ugu lehmikute geneetiline varieeruvus. Ehk siis genoomhinnatud pullid ei moodusta \u00fchegi aretustunnuse osas lehmikutest homogeensemat gruppi \u2013 \u00fcksk\u00f5ik, mis tunnus vaatluse alla v\u00f5tta, leidub selle osas (sarnaselt lehmikutele) nii paremaid kui ka halvemaid pulle.<\/li>\n
  • V\u00f5rreldes genoomhinnatud EHF lehmikutega on genoomhinnatud EHF pullide aretusv\u00e4\u00e4rtused pisut madalamad \u2013 seda just piima- ja rasvatoodangu, karjasp\u00fcsivuse ja sigivuse ning tervisetunnuste osas. \u00dchelt poolt saab seda seletada erinevusega s\u00fcnniaastates \u2013 genoomhinnatud lehmikud (s\u00fcnniaastatega 2018-2020) on pisut nooremad kui genoomhinnatud pullid (s\u00fcnniaastatega 2015-2019) \u2013 ja sellest tulenevas loomulikus geneetilises progressis. Teisalt v\u00f5ib siin peegelduda v\u00e4lismaise aretusmaterjali (so importpullide) m\u00f5ju.<\/li>\n
  • Mitte \u00fchegi tunnuse puhul ei leidu \u00fchtegi tipp-pulli. Ega ka \u00fchtki mistahes tunnuse osas v\u00e4ga kehva pulli. K\u00fcll on oma geneetilise potentsiaali poolest erandlikke loomi lehmikute hulgas. Kas just maailma, aga Eesti mastaabis kindlasti. Kuna lehmadele nende endi n\u00e4itajate alusel aretusv\u00e4\u00e4rtuste hindamiseks tuleb aastaid oodata ja ka siis ei ole hinnangute t\u00e4psus eriti k\u00f5rge, annavad noorloomadele hinnatud genoomaretusv\u00e4\u00e4rtused hea v\u00f5imaluse mingi tunnuse \u2013 kas siis piimaj\u00f5udluse v\u00f5i hoopis haigusriskide \u2013 osas erandlike loomade varajaseks tuvastamiseks.<\/li>\n
  • Sama pulli t\u00fctarde genoomaretusv\u00e4\u00e4rtused on erinevad ning mistahes tunnuse puhul leidub nii k\u00f5rge kui ka madala aretusv\u00e4\u00e4rtusega pullide j\u00e4rglaste hulgas nii k\u00f5rge kui ka madala aretusv\u00e4\u00e4rtusega lehmikuid. Muidugi erinevas proportsioonis, aga ikkagi leidub. Kuna tavap\u00e4raste aretusv\u00e4\u00e4rtuste alusel on sama pulli t\u00fctardele p\u00e4randunud erinevate geenivariantide m\u00f5ju v\u00f5imalik hinnata alles aastate p\u00e4rast, siis ei ole ka siin genoomaretusv\u00e4\u00e4rtustele alternatiivi.<\/li>\n
  • K\u00f5igi aretusv\u00e4\u00e4rtuste puhul eksisteerib nii erinevatest aretusotsustest tulenev erinevus farmide keskmiste tasemete vahel kui ka suuresti juhuslikust genoomide kombineerimisest tulenev farmide sisene varieeruvus. Viimane on suhteliselt sarnane k\u00f5igi farmide ja aretusv\u00e4\u00e4rtuste puhul, n\u00e4idates, et k\u00f5igis farmides leidub geneetiliselt potentsiaalilt erinevaid loomi mistahes \u00fcldise aretustunnuse osas.<\/li>\n
  • Rohkem kui kolmandik EHF lehmikutest (34,9%) on \u03b2-kaseiini genot\u00fc\u00fcbiga A2A2, mis on ka sagedaseim homos\u00fcgootne genot\u00fc\u00fcp selles lookuses, ja alleeli A2 sagedus on 57,0%. Piima halvema laapumisega seotud \u03ba-kaseiini E-alleeli sagedus on 11,0%, seejuures on E-alleeli suhtes homos\u00fcgootseid lehmikuid 1,4%, ning piima laapumisega positiivselt seotud \u03ba-kaseiini B-alleeli sagedus on 35,9% ja B-alleeli suhtes homos\u00fcgootseid lehmikuid on 12,7%.<\/li>\n<\/ul>\n

     <\/p>\n

    Kokkuv\u00f5te eesti punast t\u00f5ugu lehmikute genoomaretusv\u00e4\u00e4rtustest<\/strong><\/h4>\n
      \n
    • Genoomhinnatud eesti punast t\u00f5ugu (EPK) lehmikute hulgas eksisteerib k\u00f5igi hinnatud aretusv\u00e4\u00e4rtuste ja -indeksite osas valikute tegemiseks piisav geneetiline varieeruvus. Siiski on varieeruvus suhteliselt suurem piimaj\u00f5udlusn\u00e4itajate ja v\u00e4iksem tervisetunnuste osas. Kuna Eestis geneetilisi haigusriske (so haiguste aretusv\u00e4\u00e4rtuseid) veel ei hinnata, enamuse farmide puhul ei talletata andmebaasides ka loomade haiguste ja ravi andmeid, on loomade genoomiandmete alusel v\u00e4lismaal \u00fclimahukate andmebaaside alusel arvutatud genoomaretusv\u00e4\u00e4rtused ainsad v\u00f5imalused geneetiliste riskide populatsioonip\u00f5hise varieeruvuse ja individuaalsete geneetiliste riskide hindamiseks.<\/li>\n
    • V\u00f5rreldes P\u00f5hjamaadega on EPK lehmikutel madalamad terviseriskidega seotud \u00fcldaretusv\u00e4\u00e4rtused \u2013 suhteline udaratervise \u00fcldaretusv\u00e4\u00e4rtus, suhteline tervise \u00fcldaretusv\u00e4\u00e4rtus ja eelk\u00f5ige s\u00f5ratervise indeks. Viitab see sellele, et pullide valikul ei ole eriti palju juhindutud nende poolt j\u00e4rglastele p\u00e4randatavatest terviseriskidest. Samas on keskmine noorkarja eluj\u00f5ulisuse aretusv\u00e4\u00e4rtus (m\u00f5\u00f5dab loomade geneetilist potentsiaali p\u00fcsida karjas kuni t\u00e4isealiseks saamiseni) EPK lehmikutel k\u00f5rgem.<\/li>\n
    • S\u00f5ratervise indeksi keskmine v\u00e4\u00e4rtus on k\u00fcll kehvemapoolne, aga varieeruvus on 1,5-2 korda suurem, kui teistel aretusv\u00e4\u00e4rtustel ja -indeksitel. See t\u00e4hendab, et EPK lehmikute hulgas leidub suhteliselt suurel hulgal ka v\u00e4ga madala geneetilise jala- ja s\u00f5rahaiguste riskiga (ehk k\u00f5rge aetusv\u00e4\u00e4rtusega) lehmikuid, aga ka \u00fcksjagu \u00fclimalt suure geneetilise riskiga lehmikuid. Hetkel nende varajaseks tuvastamiseks peale genoomaretusv\u00e4\u00e4rtuste v\u00f5imalusi pole.<\/li>\n
    • Paljude aretusv\u00e4\u00e4rtuste osas jagunevad EPK lehmikud kahte gruppi, kusjuures suhtelise koguaretusv\u00e4\u00e4rtuse, suhteliste udara tervise, tootliku aja, sigivuse ja poegimise aretusv\u00e4\u00e4rtuste osas jookseb piir ligikaudu Eesti p\u00e4ritolu pullide j\u00e4rglaste ja P\u00f5hjamaade p\u00e4ritolu pullide j\u00e4rglaste vahelt \u2013 Eesti p\u00e4ritolu pullide t\u00fctarde keskmine geneetiline potentsiaal on madalam.<\/li>\n
    • Suhtelise piimaj\u00f5udluse aretusv\u00e4\u00e4rtuse osas \u2013 kus samuti eristuvad k\u00f5rgema ja madalama piimaj\u00f5udluse potentsiaaliga loomade grupid \u2013 on erineva p\u00e4ritoluga isade t\u00fctarde keskmised suhteliselt sarnased. K\u00fcll aga on suhtelise piimaj\u00f5udluse aretusv\u00e4\u00e4rtuse jaotused bimodaalsed (n\u00f6 kahe k\u00fc\u00fcruga) k\u00f5igi isade p\u00e4ritolumaade puhul. Et sarnane trend ilmneb pisut n\u00f5rgamalt ka paljude teiste aretusv\u00e4\u00e4rtuste puhul, peegeldab see mingit \u00fcldisemat suundumust punaste t\u00f5ugude aretuses.<\/li>\n
    • Rohkem kui kolmandik EPK lehmikutest (36,5%) on \u03b2-kaseiini genot\u00fc\u00fcbiga A2A2, mis on ka sagedaseim homos\u00fcgootne genot\u00fc\u00fcp selles lookuses.<\/li>\n<\/ul>\n

       <\/p>\n

      Soovitused<\/h4>\n

      Anal\u00fc\u00fcsist selgub vajadus juurutada farmides ja sellega kaasnevalt ka j\u00f5udluskontrollis tervisev\u00e4\u00e4rtuste hindamine. Haigusriskide (so haiguste aretusv\u00e4\u00e4rtuseid) hindamiseks tuleks talletada andmebaasides ka loomade haiguste ja ravi andmeid. Sinnamaani on loomade genoomiandmete alusel v\u00e4lismaal \u00fclimahukate andmebaaside alusel arvutatud genoomaretusv\u00e4\u00e4rtused ainsad v\u00f5imalused geneetiliste riskide populatsioonip\u00f5hise varieeruvuse ja individuaalsete geneetiliste riskide hindamiseks.<\/p>\n

      P\u00fcsivalt registreeritavad andmed v\u00f5iksid olla:<\/p>\n

        \n
      • S\u00f5ratervise tunnused<\/li>\n
      • Mastiit<\/li>\n
      • Ainevahetushaigused<\/li>\n<\/ul>\n

        Kuvada EPJ programmis Vissuke soovitused v\u00e4\u00e4rtuste hindamisele, kuna tunnused eri riikides on erinevad.<\/p>\n

        Eraldi k\u00fcsimus, kas on vaja ka sisse seada Eesti indeksite (aretusv\u00e4\u00e4rtuste) uuendamine, mis v\u00f5iks toimuda n\u00e4iteks iga 5 aasta tagant. See on vajalik mitte ainult koost\u00f6\u00f6ks vaid tarvilik ka loomakasvatajatele ning aretajatele eri loommaterjali soetamisel ning tulemuste hindamisel.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

        Eesti piimaveiste populatsiooni valimi hindamine genoomaretusv\u00e4\u00e4rtuse alusel toimus vastavalt suurima holsteini populatsiooniga Saksamaa aretusv\u00e4\u00e4rtuste alusel (eesti hol\u0161teini t\u00f5ug, EHF)\u00a0 ja eesti punase t\u00f5ugu (EPK) loomad P\u00f5hjamaade aretusv\u00e4\u00e4rtuste alusel. Tegevuse eesm\u00e4rk oli anda hinnang siinse populatsiooni aretusv\u00e4\u00e4rtuste sidumise v\u00f5imalikkusest ja hindamise alustamisest EuroGenoomi kuuluva ja sellega seotud organisatsioonide abil: Saksamaa hol\u0161teini populatsioon (GGI-Spermex) eesti ho\u0161teini t\u00f5u […]<\/p>\n","protected":false},"author":2,"featured_media":547,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"leht-pildiga.php","meta":{"footnotes":""},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1212"}],"collection":[{"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/users\/2"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=1212"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/1212\/revisions"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/media\/547"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/piimaklaster.ee\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=1212"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}